近年来，随着我国经济的快速发展和医疗卫生体制改革的不断深入，医疗卫生市场竞争日趋激烈，各类医院特别是公立医院纷纷采取现代化的经营管理模式， 以下就是大型公立医院内部控制审计的实施方法。
1 公立医院内控审计体系存在的主要问题
内控审计体系虽然在公立医院的正常运转中发挥了重要作用，但从目前的运转情况看，还存在一些亟待解决的问题。主要有以下几方面。
1.1 管理部门认识缺位，内控审计体系建设亟待强化
在传统的管理体制和机制下，目前我国公立医院的领导管理机构依然由业务型医疗专家组成，管理模式上习惯于以传统的行政命令式为主，对内控审计体系建设的重要性认识不足。面对激烈的市场竞争，许多医院虽然也引入了内控审计体系，但各项管理制度和管理办法还不健全、不完善，许多工作还停留在制度设计和表面形式上，缺少对体系整体性、系统性的理解和研究。同时，由于缺少专业性的管理人才，不能熟练灵活地把握和运用内控审计体系的操作程序及各控制点的具体实施，内控审计管理人员素质亟待提升。
1.2 内控基础薄弱，各项措施的落实存在漏洞
医院内控审计体系建设是一项系统性、复杂性的工程。由于医院内部管理部门众多，比如药品采购、器材设备采购、基建管理、后勤保障以及财务管理等，内控体系需要各部门之间的协作配合，才能真正发挥其应有作用。但在现行的管理体制机制下，部门间各自为战的现象时有发生，许多内控措施落实不到位，大大削弱了内控体系的基础。此外，如果按照内控体系的有关规定严格执行，将大大提高医院现有的运行成本，必然会大量增加资金投入，而医院管理层显然不愿接受这一结果，从而导致内控审计体系各项措施落实执行不到位。
1.3 内部监督机制有待进一步完善
通过对公立医院的调查发现，内控审计体系不能有效发挥作用的重要原因在于内部缺乏有效的监督和评价体制。许多医院的监督机构缺乏统一的标准体系，而且在监督过程中流于形式，不能真正发挥职能作用，特别是对领导层的管理缺乏有效约束，部门之间、岗位之间不能有效制衡，导致监督评价机制作用的发挥大打折扣。
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