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传统中医理论是具有自然哲学特征的非实证性为主要表现的理论，这种理论只有形式上的意义，中医学的实质是长期积淀的经验，中医理论现代化就是建立新的与现代各种科学理论有共同特征的以实证性为主要表现的中医理论，使中医从自然哲学、经验科学成长为理论科学。简言之，即"夫业医诊病，当先明脏腑。"（王清任）
　　理论科学相对于经验科学的优势，一是真理性强；二是在发展上常呈质的飞跃的加速型发展。就医学而言，即"基础医学每前进一步，临床医学就会前进十步。"这是中医理论现代化的意义。
　　2.经验和理论是人类认识自然界的两种知识类型。经验是人对客观事物的直接观察体验，属感性认识。经验蕴含着真理，但具有表象性，主观性，偶然性等缺点。理论是人对客观事物内在的、本质性规律的认识，属理性认识。
　　理论科学以"大"理论为标志。即①学科的知识体系以理论为中心构成 ，理论是学科的代表；②理论发展是学科发展的动力【1】。经验科学则相反。
　　自然科学发展史表明，古代科学技术的发展以经验性知识为主，如灌溉技术，造纸术，历法，火药及指南针的发明，铁的熔炼法，丝织技术等；而近、现代科学技术发展主要则是理论，如太阳中心说，万有引力定律，光的波动与微粒说，氧化理论，进化论，能量守恒与转换定律，相对论，量子力学，板块构造理论，系统论等以及在理论指导下的技术如电力技术，放射线技术，原子能技术，分子生物学技术等【2】。医学的发展也是如此，古代总结了许多治病经验， 而近、现代医学则是从《论人类机体的构造》开始【3】。
　　3.现代中医理论研究已完成了相当大的工作量，①研究全方位采用了从现代哲学、科学哲学、现代科学各学科的原理及技术、方法。如80年代初兴起的中医多学科研究；②研究在中医学各领域如生理、病理、治则、药理、经络等全方位展开及发展；③研究形成了从宏观到微观的、符合现代科学理论实证性特征的多种现代中医理论；④上述理论已有相当成熟度而有大量现代中医理论专著出版。如：《现代中医生理学基础》（季钟朴）、《中医免疫》（刘正才），《中医病理研究》（匡调元），《中医体质学说》（王琦），《祖国医学肾的研究》（姜春华）、《中医理论现代研究》（沈自尹）、《舌诊研究》（陈泽霖）、《中医脾胃学说应用研究》（危北海）、《中医药药理毒理与临床》（李广勋）等。上述几方面表现甚至在现有水平上出现了"饱和"迹象。这些工作无疑是中医现代化事业的最重要进展。
　　但是，现代中医理论研究的丰硕成果并未使中医学出现从自然哲学、经验科学向理论科学的转变，①中医学框架没有改变，显示其知识体系仍以经验为中心；经验是学科的代表。②中医学的发展动力仍是经验的总结。新的辨证方案、新药的产生仍靠临床医生个人经验积累。中医学仍呈缓慢的经验积累型，而非理论科学的变革、加速发展型。
　　总之，现代中医理论研究产生的现代中医理论呈现与其学术性质、成就不相称的"小"理论特征。
　　 "小"理论特征损害了对这一事业的信任。理论研究可有可无的想法带有普遍性。在证候实质研究领域，出现了以"药→方→法→理"研究及"病－方"研究取而代之的想法，经络实质研究的必要性更经历了大的波澜。证候发生机理研究在国家"八五"攻关项目中未受重视。中医多学科研究转入低潮，等。
　　 "小"理论问题直接阻碍中医理论现代化及中医现代化进程。

 

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